Protein–RNA interactions for Protein: E0CXM8

Gm43720, Predicted gene 43720, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm43720E0CXM8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm43720E0CXM8 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm43720E0CXM8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms