Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Tgfbr3lD3YZZ2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Tgfbr3lD3YZZ2 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Tgfbr3lD3YZZ2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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