Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms