Protein–RNA interactions for Protein: D3YVL2

Cfap70, Cilia and flagella-associated protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap70D3YVL2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap70D3YVL2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cfap70D3YVL2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms