Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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