Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cspp1B2RX88 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms