Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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