Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC6

Cad, CAD protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CadB2RQC6 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms