Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms