Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms