Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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