Protein–RNA interactions for Protein: A3KFM7

Chd6, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd6A3KFM7 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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