Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r232A2RTT5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r232A2RTT5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r232A2RTT5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r232A2RTT5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r232A2RTT5 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r232A2RTT5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r232A2RTT5 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r232A2RTT5 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r232A2RTT5 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms