Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Fam43bA2AM80 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Fam43bA2AM80 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Fam43bA2AM80 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam43bA2AM80 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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