Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms