Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms