Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Speer3W4VSP1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Speer3W4VSP1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Speer3W4VSP1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Speer3W4VSP1 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Speer3W4VSP1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Speer3W4VSP1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Speer3W4VSP1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Speer3W4VSP1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Speer3W4VSP1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Speer3W4VSP1 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Speer3W4VSP1 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Speer3W4VSP1 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Speer3W4VSP1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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