Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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