Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ubl3Q9Z2M6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ubl3Q9Z2M6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ubl3Q9Z2M6 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ubl3Q9Z2M6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ubl3Q9Z2M6 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ubl3Q9Z2M6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ubl3Q9Z2M6 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ubl3Q9Z2M6 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ubl3Q9Z2M6 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ubl3Q9Z2M6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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