Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms