Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Clip2Q9Z0H8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Clip2Q9Z0H8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Clip2Q9Z0H8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Clip2Q9Z0H8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Clip2Q9Z0H8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Clip2Q9Z0H8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Clip2Q9Z0H8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Clip2Q9Z0H8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Clip2Q9Z0H8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Clip2Q9Z0H8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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