Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Snx1Q9WV80 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Snx1Q9WV80 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Snx1Q9WV80 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Snx1Q9WV80 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms