Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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