Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms