Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms