Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col4a4Q9QZR9 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col4a4Q9QZR9 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Col4a4Q9QZR9 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col4a4Q9QZR9 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col4a4Q9QZR9 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col4a4Q9QZR9 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Col4a4Q9QZR9 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col4a4Q9QZR9 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Col4a4Q9QZR9 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Col4a4Q9QZR9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col4a4Q9QZR9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col4a4Q9QZR9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col4a4Q9QZR9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col4a4Q9QZR9 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col4a4Q9QZR9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col4a4Q9QZR9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col4a4Q9QZR9 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col4a4Q9QZR9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Col4a4Q9QZR9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Col4a4Q9QZR9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Col4a4Q9QZR9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Col4a4Q9QZR9 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Col4a4Q9QZR9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Col4a4Q9QZR9 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Col4a4Q9QZR9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Col4a4Q9QZR9 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Col4a4Q9QZR9 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Col4a4Q9QZR9 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Col4a4Q9QZR9 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Col4a4Q9QZR9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Col4a4Q9QZR9 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col4a4Q9QZR9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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