Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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