Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rabgef1Q9JM13 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rabgef1Q9JM13 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rabgef1Q9JM13 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rabgef1Q9JM13 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rabgef1Q9JM13 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Rabgef1Q9JM13 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rabgef1Q9JM13 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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