Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Higd1aQ9JLR9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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