Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Col5a3Q9JLI2 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Col5a3Q9JLI2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
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Col5a3Q9JLI2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms