Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nectin3Q9JLB9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Nectin3Q9JLB9 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nectin3Q9JLB9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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