Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms