Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX2

Sp6, Transcription factor Sp6, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp6Q9ESX2 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Sp6Q9ESX2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Sp6Q9ESX2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Sp6Q9ESX2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp6Q9ESX2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms