Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim39Q9ESN2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Trim39Q9ESN2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms