Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
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Rb1cc1Q9ESK9 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
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Rb1cc1Q9ESK9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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Rb1cc1Q9ESK9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
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Rb1cc1Q9ESK9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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Rb1cc1Q9ESK9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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Rb1cc1Q9ESK9 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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Rb1cc1Q9ESK9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms