Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms