Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms