Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

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Length 1,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scn4aQ9ER60 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scn4aQ9ER60 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scn4aQ9ER60 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scn4aQ9ER60 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Scn4aQ9ER60 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scn4aQ9ER60 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn4aQ9ER60 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn4aQ9ER60 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn4aQ9ER60 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn4aQ9ER60 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn4aQ9ER60 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn4aQ9ER60 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn4aQ9ER60 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn4aQ9ER60 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn4aQ9ER60 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn4aQ9ER60 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn4aQ9ER60 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn4aQ9ER60 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn4aQ9ER60 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn4aQ9ER60 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn4aQ9ER60 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn4aQ9ER60 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn4aQ9ER60 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn4aQ9ER60 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn4aQ9ER60 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn4aQ9ER60 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn4aQ9ER60 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn4aQ9ER60 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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