Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Smg9Q9DB90 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Smg9Q9DB90 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Smg9Q9DB90 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Smg9Q9DB90 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Smg9Q9DB90 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Smg9Q9DB90 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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