Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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Cldn22Q9D7U6 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Cldn22Q9D7U6 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Cldn22Q9D7U6 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Cldn22Q9D7U6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Cldn22Q9D7U6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Cldn22Q9D7U6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Cldn22Q9D7U6 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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Cldn22Q9D7U6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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