Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms