Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms