Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms