Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms