Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rfc5Q9D0F6 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rfc5Q9D0F6 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rfc5Q9D0F6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rfc5Q9D0F6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfc5Q9D0F6 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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