Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Mms19Q9D071 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Mms19Q9D071 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Mms19Q9D071 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Mms19Q9D071 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms