Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Sgo1Q9CXH7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Sgo1Q9CXH7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Sgo1Q9CXH7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Sgo1Q9CXH7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms