Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrrc17Q9CXD9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc17Q9CXD9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc17Q9CXD9 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc17Q9CXD9 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc17Q9CXD9 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc17Q9CXD9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms