Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms