Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ddx28Q9CWT6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ddx28Q9CWT6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ddx28Q9CWT6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ddx28Q9CWT6 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ddx28Q9CWT6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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